南京大学数学系计算机集群


  • 登录计算机集群MATHHPC的方法
  • 如何递交计算任务
  • 软件列表


  • 登录计算机集群MATHHPC的方法有两种：

      • I. SSH登录
        本集群系统的域名是 mathhpc.nju.edu.cn。在Linux或Unix下可用如下命令
        ssh mathhpc.nju.edu.cn -l usrname 或 ssh -X usrname@mathhpc.nju.edu.cn
        登录，其中"usrname"是你的用户名，"-X"选项可以使集群上运行的程序的图形界面传到当前桌面上（X11 Forwarding）。在Windows下可用SSH客户端软件登录。如果想在Windows下实现X11 Forwarding功能，可安装Xming并和SSH程序配合使用，参见帮助一或帮助二。

      II. VNC登录（Windows下的Linux图形桌面）
      1. 用SSH登录到 mathhpc.nju.edu.cn
      2. 输入命令"vncserver"并回车。头一次运行vncserver时系统会提示设置VNC登录密码。设置密码后系统会返回形如下面的一段话：
        New 'mathhpc.nju.edu.cn:2 (usrname)' desktop is mathhpc.nju.edu.cn:2
        其中"2"为桌面号，每次可能不同。以后如想修改VNC密码，可用"vncpasswd"命令。
      3. 运行"vncserver"后，在Windows上运行VNC viewer，在出现的对话框的"server"一栏输入"mathhpc.nju.edu.cn:2"（其中"2"换成你的桌面号）， 然后点击"OK"，用你的VNC登录密码登录。验证成功后会出现一个Linux桌面图形窗口，你可以使用系统中安装的所有应用程序了。
      4. 退出VNC：先关闭Linux桌面窗口，然后在SSH窗口中运行如下格式的命令
        vncserver -kill :2
        （把其中的"2"换成你的桌面号）关闭VNC进程，这一步一定要做。

        5. VNC详细使用方法见Real VNC使用说明


  • 如何递交计算任务▲

      • 本集群采用SUN的SGE递交任务。 例如有一个串行任务yourjob要递交，可先编写脚本
        #!/bin/bash
        #$ -cwd
        #$ -j y
        #$ -S /bin/bash
        ./yourjob
      存为yourjob.sh。其中最后一行是你的任务命令。再用命令 qsub yourjob.sh 递交任务。系统会返回任务号(比如"16")。屏幕输出默认存在文件 yourjob.sh.o16（16为任务号）中。可以用"qstat" 命令查看任务状态，用"qdel"命令删除任务，比如用命令"qdel 16"（16为任务号）。 详细说明见SGE说明书。


  • 软件列表(注意：除自由软件外，其他软件目 前无法使用，除非经过授权才能安装只用。)▲


    • 如果需要帮助或有建议请发Email给梅加强或武海军。