南京大学数学系计算机集群


  • 登录计算机集群MATHHPC的方法
  • 如何递交计算任务
  • 软件列表



  • 登录计算机集群MATHHPC的方法有两种:

    • I. SSH登录
        本集群系统的域名是 mathhpc.nju.edu.cn。在Linux或Unix下可用如下命令
        ssh mathhpc.nju.edu.cn -l usrname 或 ssh -X usrname@mathhpc.nju.edu.cn
        登录,其中"usrname"是你的用户名,"-X"选项可以使集群上运行的程序的图形界面传到当前桌面上(X11 Forwarding)。在Windows下可用SSH客户端软件登录。如果想在Windows下实现X11 Forwarding功能,可安装Xming并和SSH程序配合使用,参见帮助一帮助二

      II. VNC登录(Windows下的Linux图形桌面)
      1. 用SSH登录到 mathhpc.nju.edu.cn
      2. 输入命令"vncserver"并回车。头一次运行vncserver时系统会提示设置VNC登录密码。设置密码后系统会返回形如下面的一段话:
        New 'mathhpc.nju.edu.cn:2 (usrname)' desktop is mathhpc.nju.edu.cn:2
        其中"2"为桌面号,每次可能不同。以后如想修改VNC密码,可用"vncpasswd"命令。
      3. 运行"vncserver"后,在Windows上运行VNC viewer,在出现的对话框的"server"一栏输入"mathhpc.nju.edu.cn:2"(其中"2"换成你的桌面号), 然后点击"OK",用你的VNC登录密码登录。验证成功后会出现一个Linux桌面图形窗口,你可以使用系统中安装的所有应用程序了。
      4. 退出VNC:先关闭Linux桌面窗口,然后在SSH窗口中运行如下格式的命令
        vncserver -kill :2
        (把其中的"2"换成你的桌面号)关闭VNC进程,这一步一定要做。

      5. VNC详细使用方法见Real VNC使用说明



  • 如何递交计算任务

    • 本集群采用SUN的SGE递交任务。 例如有一个串行任务yourjob要递交,可先编写脚本
        #!/bin/bash
        #$ -cwd
        #$ -j y
        #$ -S /bin/bash
        ./yourjob
      存为yourjob.sh。其中最后一行是你的任务命令。再用命令 qsub yourjob.sh 递交任务。系统会返回任务号(比如"16")。屏幕输出默认存在文件 yourjob.sh.o16(16为任务号)中。可以用"qstat" 命令查看任务状态,用"qdel"命令删除任务,比如用命令"qdel 16"(16为任务号)。 详细说明见SGE说明书



  • 软件列表(注意:除自由软件外,其他软件目 前无法使用,除非经过授权才能安装只用。)



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